세포자살이 이루어진 결과에 대하여 이를 깨끗하게 치워야 하는 임무는 크게 세 가지로 나뉘어진다.
첫째 방법은 거대세포(macrophages)에 의한 식균작용을 통하는 길이고, 둘째는 세포자살이 이루어진 주변 세포들이 흡수하는 길이고, 셋째는 피부의 세포나 장 내면의 세포와 같이 몸으로부터 떨어져 나가는 길이다.
첫째 방법인 식균 과정에서 거대세포가 세포자살이 이루어진 후 부스러진 세포핵 물질을 제대로 알아 본 후 이를 온전히 치워야 하는데 이 과정에서 문제가 발생했을 때 생기는 항원/항체 복합물질(antigen/antibody complex)이 조직에 침전함으로 발생하는 것이 각종 자가면역질환인 것이다.
